correct lane numbers

    fi

    sn=`echo ${name} | cut -f 1-$((${name_fields} - 4)) -d'_'`

    # removes leading zeroes from lane number

    lane=`echo ${name} | cut -f $((${fields} - 2)) -d'_' | sed 's/L0([123456789][0123456789])/\$1/' | sed 's/L00([0123456789])/\$1/'`

    lane=`echo ${name} | cut -f $((${fields} - 2)) -d'_' | sed -E 's/L([123456789][0123456789][0123456789])/\1/' | sed -E 's/L0([123456789][0123456789])/\1/' | sed -E 's/L00([0123456789])/\1/'`

    # sets lane to 0 if none found

    if [[ -z ${lane} ]]; then

        lane=0