Support asan=1 for make

CXX=g++

CXXFLAGS=-std=c++11 -Wall -O3 -fopenmp -msse4.1

LDFLAGS=-lm -lz

cpp_source=sequence_batch.cc index.cc ksw.cc output_tools.cc chromap.cc

src_dir=src

objs_dir=objs

objs+=$(patsubst %.cc,$(objs_dir)/%.o,$(cpp_source))

cxx=g++

cxxflags=-std=c++11 -Wall -O3 -fopenmp -msse4.1

ldflags=-lm -lz

exec=chromap

ifneq ($(asan),)

	CXXFLAGS+=-fsanitize=address

	LDFLAGS+=-fsanitize=address -ldl

endif

all: dir $(exec) 

dir:

	mkdir -p $(objs_dir)

$(exec): $(objs)

	$(cxx) $(cxxflags) $(objs) -o $(exec) $(ldflags)

	$(CXX) $(CXXFLAGS) $(objs) -o $(exec) $(LDFLAGS)

$(objs_dir)/%.o: $(src_dir)/%.cc

	$(cxx) $(cxxflags) -c $< -o $@

	$(CXX) $(CXXFLAGS) -c $< -o $@

.PHONY: clean

clean: