Add files via upload

chr17	39840997	39850829

# source

cp /raid/USRdirs/Buenrostro_data/02_20130527_singleCell/23_mitoBlackList/JDB_blacklist.bed hg19_blacklist.JDB.bed

cp /raid/USRdirs/Buenrostro_data/02_20130527_singleCell/23_mitoBlackList/mm9/JDB_blacklist.mm9.v2.bed mm9_blacklist.JDB.bed 

chr1	564215	570552

chr1	724136	727043

chr1	825006	825115

chr1	2583334	2634374

chr1	4363064	4363242

chr1	5725866	5736651

chr1	5910121	5910656

chr1	16839923	16841396

chr1	38077097	38077671

chr1	50482688	50483219

chr1	91852785	91853147

chr1	104163528	104164070

chr1	108112972	108113707

chr1	121351474	121487059

chr1	142535434	142543081

chr1	142723256	142723968

chr1	142792613	142793303

chr1	142835822	142837333

chr1	143274490	143284340

chr1	145277108	145277572

chr1	149033183	149035829

chr1	156186169	156186712

chr1	215672889	215673425

chr1	224199390	224204260

chr1	233318467	233318516

chr1	236260366	236260821

chr1	237766308	237766764

chr1	238104292	238104810

chr1	238105345	238105511

chr1	238106762	238107280

chr1	238107952	238108489

chr1	238108645	238109697

chr10	18841533	18862467

chr10	20035494	20037324

chr10	36722282	36723650

chr10	37890121	37890639

chr10	38772277	38819357

chr10	38868892	38889025

chr10	39076515	39155771

chr10	42354835	42548642

chr10	42596676	42602110

chr10	42661264	42667623

chr10	42790522	42818398

chr10	135498649	135502716

chr11	6831669	6831838

chr11	10529184	10532020

chr11	48671444	48902406

chr11	48931242	48964015

chr11	50318471	50784078

chr11	51090700	51374066

chr11	51567242	51594226

chr11	54694046	55027975

chr11	73221528	73222074

chr11	85194913	85195322

chr11	87524468	87525005

chr11	103275584	103281729

chr11	122874063	122874602

chr12	20704285	20704583

chr12	34372315	34372825

chr12	34432130	34857010

chr12	37989447	38441828

chr12	38531376	38531930

chr12	41757194	41757775

chr12	127650407	127651075

chr12	132061320	132062046

chr13	56545728	56545925

chr13	110076221	110076938

chr14	18999935	19056900

chr14	32953215	32954570

chr14	84637832	84639038

chr14	90341302	90341516

chr15	19999941	20044132

chr16	3421728	3422263

chr16	32493036	32570826

chr16	32590063	32598801

chr16	33237130	33241330

chr16	33864355	34023306

chr16	34180542	34197081

chr16	34530115	34542632

chr16	35193580	35285885

chr16	46385718	46456668

chr16	46497639	46500515

chr16	47538629	47539297

chr16	69392363	69392903

chr17	19355538	19356096

chr17	19502495	19506947

chr17	21905167	21906712

chr17	22018524	22032049

chr17	22221073	22263006

chr17	25263010	25268059

chr17	25415551	25417559

chr17	31149365	31149981

chr17	33478114	33478372

chr17	41381502	41382591

chr17	41463538	41464075

chr17	41464478	41465015

chr17	41465562	41467288

chr17	51182904	51183994

chr17	55868618	55868752

chr17	75158031	75158430

chr17	78591153	78591671

chr18	96416	97552

chr18	105658	112233

chr18	2842017	2842573

chr18	15393801	15393992

chr18	18510894	18520356

chr18	44126235	44126593

chr18	45379393	45380009

chr18	50319086	50319301

chr18	59541728	59542261

chr18	77772846	77773065

chr19	246006	247844

chr19	22877614	22877696

chr19	23235030	23235504

chr19	24182398	24186210

chr19	24385474	24633168

chr19	27730611	28262682

chr19	36066445	36066810

chr19	36756398	36800948

chr19	37759473	37797722

chr19	44914313	44916340

chr19	44960681	44962681

chr2	739925	740994

chr2	33992287	33992840

chr2	49456527	49457216

chr2	88124159	88125119

chr2	89830421	89880514

chr2	90371401	90394776

chr2	90443001	90545431

chr2	91595080	91616015

chr2	92267428	92326280

chr2	95564651	95565190

chr2	115695017	115695281

chr2	117780922	117781440

chr2	132966248	132989300

chr2	132994855	133007983

chr2	133011824	133013298

chr2	133036250	133040042

chr2	133044095	133045945

chr2	143846143	143846679

chr2	143848503	143848792

chr2	148022533	148023068

chr2	149639082	149639670

chr2	156120282	156120806

chr2	162135000	162139241

chr2	212640605	212641123

chr2	227586739	227587272

chr2	230045426	230045796

chr20	9149320	9149861

chr20	26257032	26320267

chr20	29517710	29521147

chr20	29803876	29833334

chr20	55933958	55934493

chr20	55935107	55935648

chr20	62916702	62918053

chr21	9647205	9648529

chr21	9694896	9704962

chr21	9825451	9845233

chr21	9881895	9882569

chr21	10084922	10088004

chr21	10492633	10493292

chr21	10599428	10599915

chr21	10697886	10860890

chr21	11186054	11188131

chr21	14338127	14369791

chr21	18800575	18800997

chr21	27228003	27228242

chr21	46795901	46796439

chr22	16847814	16862659

chr22	18876789	18884510

chr22	36281479	36282013

chr3	25508897	25509131

chr3	68708013	68708531

chr3	73159606	73161131

chr3	75696297	75699304

chr3	75717841	75720426

chr3	80995858	81014459

chr3	90311686	90507410

chr3	93504815	93519133

chr3	96335833	96337558

chr3	160665192	160665814

chr3	196625514	196625860

chr3	197825427	197834080

chr4	9987	12694

chr4	12276463	12292424

chr4	12641862	12642305

chr4	21583630	21583719

chr4	27731857	27732439

chr4	47774093	47774614

chr4	49085372	49342114

chr4	49488472	49662085

chr4	52659961	52688986

chr4	56194076	56194696

chr4	65473624	65474162

chr4	68264186	68266830

chr4	70296565	70296841

chr4	76807083	76807320

chr4	78929488	78930103

chr4	93622884	93623402

chr4	117219155	117219678

chr4	129002631	129003176

chr4	156383228	156383746

chr4	156384860	156387314

chr4	163342349	163342899

chr4	190190746	190203442

chr4	190801869	190802909

chr4	190943802	190943962

chr4	190987268	190990949

chr4	191026302	191044344

chr5	8622399	8622932

chr5	17517177	17600940

chr5	21477365	21497415

chr5	34177882	34197574

chr5	45908253	46411114

chr5	49405493	49554574

chr5	60057115	60057667

chr5	71146650	71146996

chr5	79945623	79948246

chr5	93903068	93906726

chr5	97746525	97746679

chr5	99381556	99390873

chr5	105888898	105889439

chr5	123096715	123097256

chr5	134258843	134264404

chr5	165957179	165957715

chr5	174541634	174542177

chr6	58735349	58739031

chr6	58745955	58780547

chr6	61880095	61944008

chr6	62189892	62206612

chr6	62207809	62230644

chr6	62283796	62284581

chr6	133593944	133594201

chr6	137059142	137059326

chr6	150665074	150665281

chr6	153990090	153990608

chr6	157731310	157735525

chr7	43878355	43878530

chr7	45291345	45291903

chr7	56437808	56442977

chr7	57253832	57254366

chr7	57255103	57255635

chr7	57261829	57261998

chr7	57544726	57556913

chr7	57811488	57836990

chr7	57939184	58055539

chr7	61054285	62454680

chr7	64059157	64066183

chr7	64951348	64956223

chr7	68201328	68201864

chr7	68527370	68527788

chr7	80962907	80963147

chr7	100550640	100551321

chr7	141501784	141502302

chr7	141504814	141505351

chr7	142372972	142375689

chr7	145694182	145694771

chr8	155512	157639

chr8	21455971	21456306

chr8	32868808	32873375

chr8	43092737	43097573

chr8	43399486	43843604

chr8	46838215	47457541

chr8	47739043	47742896

chr8	47750844	47776101

chr8	56754955	56755418

chr8	68497449	68497998

chr8	69218401	69218922

chr8	70602248	70602620

chr8	77114045	77114579

chr8	100507848	100508386

chr9	10435	11574

chr9	4799734	4800000

chr9	5092549	5093067

chr9	5093519	5094054

chr9	33656606	33659367

chr9	42819021	42832395

chr9	44070617	44070871

chr9	44873123	44902307

chr9	45355954	45357644

chr9	45435109	45443517

chr9	66494170	66494805

chr9	66767710	66864329

chr9	66970914	67005594

chr9	67315122	67321036

chr9	67789868	67792893

chr9	68410775	68435115

chr9	69677073	69687998

chr9	69689770	69711497

chr9	69947961	70011196

chr9	70076144	70076855

chr9	70318723	70327683

chr9	72653073	72653572

chr9	78790077	78790255

chr9	79186574	79187026

chr9	83180398	83180922

chr9	141019938	141021783

chrX	55206111	55206740

chrX	55207562	55209273

chrX	55209430	55210229

chrX	58330488	58330843

chrX	58373806	58373962

chrX	58377680	58377864

chrX	58415350	58416387

chrX	58432411	58432680

chrX	58485887	58486241

chrX	58488898	58494528

chrX	58499466	58504235

chrX	58506076	58536883

chrX	58544061	58582415

chrX	61681834	61919683

chrX	62003205	62041580

chrX	83658929	83659019

chrX	108297348	108297886

chrX	110660052	110660589

chrX	114959057	115006437

chrX	125605550	125607502

chrX	125714985	125715338

chrX	125864844	125864980

chrX	125865542	125866081

chrY	313470	313613

chrY	3004989	3005175

chrY	4212571	4213142

chrY	7671817	7694928

chrY	7726064	7730229

chrY	7730734	7731598

chrY	7735811	7752887

chrY	7785067	7806311

chrY	7806856	7814704

chrY	7815230	7820478

chrY	7829937	7832032

chrY	7832744	7848695

chrY	7870343	7873582

chrY	7874115	7874584

chrY	7875409	7885257

chrY	7886545	7894591

chrY	7898927	7916812

chrY	7918790	7921352

chrY	7926344	7936705

chrY	7941130	7947438

chrY	7948790	7964448

chrY	8179010	8181143

chrY	8181757	8213330

chrY	8214629	8215637

chrY	8220421	8230061

chrY	8230686	8231546

chrY	8240772	8265916

chrY	8291535	8292942

chrY	8294002	8295175

chrY	8296944	8321375

chrY	8325813	8325929

chrY	8326678	8333466

chrY	8334027	8342387

chrY	8356544	8369346

chrY	8909560	8909925

chrY	8979254	8979818

chrY	9072781	9072993

chrY	9908430	9925608

chrY	9981952	9982126

chrY	10034864	10036712

chrY	10040627	10045657

chrY	10047773	10052533

chrY	10053695	10057722

chrY	10059394	10073694

chrY	10075082	10075781

chrY	10080736	10104539

chrY	13104530	13144368

chrY	13193966	13196535

chrY	13252193	13259484

chrY	13445957	13490591

chrY	13642186	13749784

chrY	13798522	13870984

chrY	19691913	19692524

chrY	19764063	19776198

chrY	19780600	19781704

chrY	19783669	19796396

chrY	19800068	19801419

chrY	19808085	19817100

chrY	19944298	19944581

chrY	20235195	20235478

chrY	20362679	20371694

chrY	20378360	20379711

chrY	20383383	20396110

chrY	20398075	20399179

chrY	20403581	20415713

chrY	20487248	20487859

chrY	23124788	23125577

chrY	23149027	23151205

chrY	23157969	23158245

chrY	23159001	23167737

chrY	23178886	23181770

chrY	23220740	23223625

chrY	23234125	23235822

chrY	23236898	23248080

chrY	23248729	23248851

chrY	23899295	23899388

chrY	23956449	23956628

chrY	24247659	24247700

chrY	24630999	24631040

chrY	24953159	24975657

chrY	24980997	24991235

chrY	25022753	25039185

chrY	25040153	25042421

chrY	25048332	25059258

chrY	25060235	25064798

chrY	25099139	25121882

chrY	25122419	25160800

chrY	25182404	25192372

chrY	25217722	25219409

chrY	25493588	25495275

chrY	26148315	26148450

chrY	26586905	26609405

chrY	26614745	26624983

chrY	26656502	26672934

chrY	26673902	26676170

chrY	26682081	26693007

chrY	26693984	26698547

chrY	26732883	26755623

chrY	26756160	26794538

chrY	26816148	26826116

chrY	26851466	26853153

chrY	27109247	27110934

chrY	27136281	27146249

chrY	27167859	27206241

chrY	27206778	27229502

chrY	27263848	27268411

chrY	27269388	27280315

chrY	27286226	27288494

chrY	27289462	27305895

chrY	27337415	27347656

chrY	27352996	27375497

chrY	27813984	27814119

chrY	28555026	28555353

chrY	28784129	28819695

chrY	58819367	58917648

chrY	58971913	58997782

chrY	59361267	59362785

chr10	38528030	38529790

chr10	42070420	42070660

chr16	34571420	34571640

chr16	34572700	34572930

chr16	34584530	34584840

chr16	34585000	34585220

chr16	34585700	34586380

chr16	34586660	34587100

chr16	34587060	34587660

chr16	34587900	34588170

chr16	34593000	34593590

chr16	34594490	34594720

chr16	34594900	34595150

chr16	34595320	34595570

chr16	46380910	46381140

chr16	46386270	46386530

chr16	46390180	46390930

chr16	46394370	46395100

chr16	46395670	46395910

chr16	46398780	46399020

chr16	46400700	46400970

chr1	124450730	124450960

chr20	28513520	28513770

chr20	31060210	31060770

chr20	31061050	31061560

chr20	31063990	31064490

chr20	31067930	31069060

chr20	31069000	31069280

chr21	8219780	8220120

chr21	8234330	8234620

chr2	90397520	90397900

chr2	90398120	90398760

chr3	93470260	93470870

chr4	49118760	49119010

chr4	49120790	49121130

chr5	49601430	49602300

chr5	49657080	49657690

chr5	49661330	49661570

chr1	24611291	24616433

chr1	34752816	34753334

chr1	132790750	132791529

chr10	85025724	85026338

chr10	96077274	96078136

chr11	44386975	44387493

chr11	90538563	90539387

chr12	59262722	59263346

chr12	97061178	97062037

chr12	112934160	112934694

chr13	85126311	85127733

chr17	93680439	93680973

chr18	65119609	65120234

chr18	65837078	65837630

chr2	22587038	22590784

chr2	69355287	69355915

chr3	6049482	6050005

chr3	94334365	94334904

chr4	80002347	80004537

chr4	80004623	80005450

chr5	7276597	7277547

chr5	35634042	35634582

chr5	60042469	60043298

chr6	9889695	9890404

chr6	79817909	79818596

chr8	102024408	102024950

chr9	24744883	24745417

chr9	123107115	123107664