### - s -

- scale_parameters() : params.h
- set_model_details() : model.h
- simple_circplot_coordinates() : plot_layouts.h
- simple_xy_coordinates() : plot_layouts.h
- space() : utils.h
- ssv_rna_plot() : plot_structure.h
- stackProb() : part_func.h
- str_DNA2RNA() : string_utils.h
- str_uppercase() : string_utils.h
- string_edit_distance() : stringdist.h
- subopt() : subopt.h
- subopt_circ() : subopt.h
- subopt_par() : subopt.h
- svg_rna_plot() : plot_structure.h
- vrna_sc_add_bp() : constraints_soft.h
- vrna_sc_add_bt() : constraints_soft.h
- vrna_sc_add_data() : constraints_soft.h
- vrna_sc_add_exp_f() : constraints_soft.h
- vrna_sc_add_f() : constraints_soft.h
- vrna_sc_add_hi_motif() : ligand.h
- vrna_sc_add_SHAPE_deigan() : constraints_SHAPE.h
- vrna_sc_add_SHAPE_deigan_ali() : constraints_SHAPE.h
- vrna_sc_add_SHAPE_zarringhalam() : constraints_SHAPE.h
- vrna_sc_add_up() : constraints_soft.h
- vrna_sc_free() : constraints_soft.h
- vrna_sc_init() : constraints_soft.h
- vrna_sc_minimize_pertubation() : perturbation_fold.h
- vrna_sc_remove() : constraints_soft.h
- vrna_sc_SHAPE_parse_method() : constraints_SHAPE.h
- vrna_sc_SHAPE_to_pr() : constraints_SHAPE.h
- vrna_seq_encode() : alphabet.h
- vrna_seq_encode_simple() : alphabet.h
- vrna_seq_toRNA() : string_utils.h
- vrna_seq_toupper() : string_utils.h
- vrna_stack_prob() : part_func.h
- vrna_subopt() : subopt.h
- vrna_subopt_zuker() : subopt.h